李香琴一生只有一段婚姻，十多歲時在大老倌陳錦棠的「錦添花」劇團，擔任第三花旦，當時陳錦棠的徒弟蕭仲坤，在劇團任第三生角，與李香琴有很多合作機會，一九四九年有班主邀她做正印花旦，去越南走埠登台，十七歲的琴姐與蕭仲坤、馬奎娘、陸驚鴻等組成劇班，前往越南演出，琴姐與擔任文武生的蕭仲坤日久生情，在當地結婚，並誕下女兒蕭紫筠。
兩年後回到香港，將年幼女兒交託媽媽照顧，她再去新加坡登台；香港興起粵語片時，琴姐與「桃源」公司簽下一年十部戲的片約，每部片酬一千元，其他電影公司的片約也應接不暇，事業得意，婚姻卻出現問題；琴姐坦言與與蕭仲坤結婚時，大家年紀太小了解不深，婚後經常吵鬧，兩人都覺得與其繼續吵下去，不如早點分開更好，五八年正式宣布離婚，婚姻只維持了七年，女兒由外婆代為照顧；女兒十三歲時，琴姐送女兒到英國留學，巧合的是女兒十七歲，在英國寫信告訴她，認識了一位泰國華僑，打算與對方結婚。
琴姐雖然不贊成女兒早婚，但女兒一意孤行，她也沒有辦法，婚後不久，女兒接連生下兩名兒子，琴姐三十多歲就做了外婆。她曾透露身邊不時有追求者，但自己做了外婆，再談婚論嫁「好醜」，所以一早打消了再婚念頭。她的前夫蕭仲坤，後來與「七小福」大師姐李菊華結婚，育有一名兒子蕭耀基，其後移居加拿大，於○五年因鼻咽癌去世。
琴姐早年離婚，多年來唯一的緋聞男友就是譚炳文，兩人在公在私交情深厚，琴姐曾透露與炳哥合作多年，大家經常出雙入對，一定會有閒言閒語，也難怪炳哥的太太呷醋；某年，炳哥突然表示太不開心，不想再和她做拍檔，兩人的合作關係告終。琴姐自稱不適合婚姻，因為對身邊人脾氣不好，一點小事就會被她說上半天，所以婚姻生活並不適合自己。