男童合唱團由十五世紀起興起，因為當時風俗不容許男女同團，神聖羅馬帝國王帝馬克西米利安一世要求六個男童在合唱團裏唱高音，奠定男童合唱團的基礎。不過，自十九世紀中期起，女性開始加入教堂聖詩合唱團，男童合唱團的影響力亦式微。倒是去到二十世紀初，美國再次興起男童合唱團，其中以The American Boychoir為首屈一指。近年因男女少年青春期提早來臨，男童高音在十三、四歲便開始變聲，之後部分會接受訓練成為高中音，但不少則從此跟歌唱絕緣。
